消毒是养兔场综合性预防措施中的重要一环。养兔场要建立严格的消毒制度，一般兔舍、场地及环境每天都要清扫，兔笼及用具等要清洗干净，每季度进行大清扫、大消毒1次。每月进行重点消毒1次，在进行消毒时，要根据病原体的特性、被消毒物体的性能与经济价值等因素，合理地选择消毒剂和消毒方法。
福尔马林
常用含37%~40%甲醛的溶液。常用其2%~4%水溶液浸泡器械，消毒兔舍、兔笼、地面、墙壁、饲槽及用具等。熏蒸消毒兔舍时，每立方米空间用福尔马林25毫升，水12.5毫升，两者混合后置于容器内，再放入高锰酸钾25克，在密闭条件下消毒24小时，然后打开门窗通风透气。也可用氨气中和甲醛气味，停留1天后再放入家兔。
来苏儿
常用2%浓度的水溶液可用于洗手，3%浓度的水溶液可用于兔舍、地面、墙壁、污染物及运动场地的消毒。
复合酚类（农福、农乐、菌毒敌、毒菌净等）
常用0.3%~1%的水溶液可用于兔舍、兔笼、用具、运动场地、运输车辆及兔的排泄物、分泌物的消毒。
氢氧化钠（苛性钠、烧碱）
常用2%~4%热溶液可用于兔舍、水泥地面、木制器具、陶瓷用具、养兔场入口处及运输工具的消毒。本品对金属制品有腐蚀性，对动物及人的皮肤和黏膜有损害，使用时要多加小心。
生石灰
将生石灰加等量水制成熟石灰后，再配成10%~20%浓度，用于地面、墙壁、围栏、粪池及污水沟的消毒。
草木灰水
草木灰20千克加水100升，煮沸、过滤后即成。30%草木灰水溶液常用于洗刷兔舍的地面、墙壁及饲养管理用具等。
漂白粉
每立方米河水或井水中加漂白粉6克~10克，消毒30分钟后即可作饮用水。10%~20%乳剂常用于兔舍、地面、墙壁、运输工具、排泄物及分泌物的消毒。3%的澄清液可用于食槽、饮水器及其他非金属用品的消毒。
过氧乙酸
国产过氧乙酸制品分甲液与乙液，配制时取甲液2份和乙液3份混合过夜，再配成1比20的水溶液，常用于兔舍喷雾消毒及室内空气消毒，也可用于地面、墙壁、通道、食槽、饮水槽、兔笼及用具的消毒。耐酸的塑料制品、玻璃、搪瓷、橡胶制品及其用具等，可用此液浸泡消毒。由于过氧乙酸的混合液不稳定，不可存放过久，必须现用现配。
新洁尔灭
常用0.1%水溶液用于木制品的消毒、洗手等，0.15%水溶液可用于兔舍喷雾消毒。
洗必泰
常用0.02%水溶液用于洗手，0.1%水溶液用于饲养用具及器械的消毒，0.05%水溶液用于兔舍、场地、仓库及工作室的喷雾消毒。
复合砚溶液（雅好生）
常用1%~3%溶液喷洒消毒兔舍、兔笼、用具及运动场地等，0.5%~1%溶液用于消毒医疗器械等。
百菌消
一般按1∶100~1∶300的比例配制。1∶100~1∶300浓度溶液用于兔舍、兔笼及用具消毒；1∶300浓度溶液用于消毒饲料间、手术室及伤口等；1∶500浓度用于消毒饲草等。兔场发生传染病时，病兔的分泌物、排泄物和被病兔粪尿、血液污染的土壤、场地、兔舍、兔笼、用具和饲管人员的衣服、鞋、帽等都要进行彻底消毒。兔舍、兔笼、用具及环境每2日消毒1次。当传染病扑灭后或解除封锁前，要进行终末消毒，消毒方法同上。
