病原微生物性腹泻 大肠杆菌、巴氏杆菌、魏氏梭菌、沙门氏菌、肺炎克雷伯氏杆菌、泰泽氏杆菌、轮状病毒等，以前4种病菌引发腹泻率最高。
寄生虫性腹泻 球虫、弓形体、栓尾线虫、豆状囊尾蚴、隐性孢子虫都能引发腹泻，但以球虫引发的腹泻最为常见。
霉菌和霉菌毒素性腹泻 霉菌有曲霉菌属、产毒镰刀菌属、葡萄穗霉菌属、单端孢霉菌属的霉菌；毒素有黄曲霉毒素、葡萄穗霉菌毒素、单端孢霉菌毒素、赫曲霉菌毒素等。
应激引起腹泻 如断奶方法不当、饲料变化、过冷、过热、长途运输和惊吓均能引起兔因抵抗力降低，内源病菌快速繁殖而引发腹泻。
滥用抗生素引起腹泻 兔是单胃动物，之所以能消化纤维素是因为盲肠内生存有大量有益细菌。大量使用抗菌素或长期使用抗菌素防病，在杀死肠道病原菌的同时，也杀死了肠道内大量的有益细菌，破坏了肠道内微生态系统平衡，有耐药性的病原菌大量繁殖后一旦引起腹泻就很难治愈。
低纤维素饲料引起腹泻 家兔是草食小家畜，要求饲料中组纤维占一定的比例。如果日粮中精饲料含量过高，特别是能量饲料占比例过大，容易引发腹泻。例如玉米在兔全价配合饲料中占30%以上，家兔腹泻发生率就明显提高。
