兔脑原虫寄生在宠物兔脑内而形成的一种慢性疾病就称之为脑原虫病。该病原体与微粒子虫属十分相似，但是生活方式与结构有着较大的不同，在分类上属微孢子虫纲、微孢子虫目、微粒子虫科。
初步认为，本病的传染性单位是孢子原浆(sporoplasm)；其从孢子中释出的部位是极丝末端，孢子原浆进入宿主细胞后即进行增殖，并发育为孢子。随着孢子的成熟和分离，最后宿主细胞破裂，释出孢子，开始新的生活周期。
本病主要通过传染性排泄物传播，也可通过胎盘传播。通常为阴性感染，在运输、气候变化或使用免疫抑制剂时就可出现临床症状。
