近年来，桃源高度重视畜禽养殖污染治理工作，从方案制定、机构建立、依法依规治理、加大宣传力度等方面，出台了一系列政策措施来整治畜禽养殖污染。尤其是在先进治污模式上，采用了不同的方式方法，使该县畜禽养殖污染得到有效治理。
桃源县专用蛋鸡饲养量近1000万羽，是中南五省蛋鸡养殖大县；生猪年出栏逾120万头，被列为全国生猪调出奖励大县。然而，在光环的另一面，也带给了我们养殖污染治理的难度。根据蛋鸡的行为学和笼养特点，桃源采取有机生物床发酵分解模式。经试点示范与多方论证，推广中扶大地（湖南）生态农业科技有限公司“立体有机肥生化床养殖技术”，治理蛋鸡养殖污染。目前，该县率先使用该技术的蛋鸡规模养殖户超过了50家，他们既提高了养殖技术，又达到了养殖污染治理和生态环境保护双赢。
针对中小规模猪场污水治理难的特点，采取绿狐尾藻湿地治理猪场废水。运用中国科学院亚热带农业生态研究所“南方农业、农村水体污染生态治理和资源化利用关键技术研发及示范”成果，利用多级绿狐尾藻湿地净化治理中小规模猪场废水。据测定，废水通过四级绿狐尾藻湿地净化技术处理后，NH3-N浓度降低98%、TP浓度降低79.2%、COD浓度降低93%。目前，全县已有30余家生猪中小规模养殖场应用该技术，真正实现了达标排放。
